关键时刻，岳托协同三弟萨哈璘劝代善拥立皇太极。代善放弃自己登位，转而接受岳托等人的安排。因为代善心中很明白，他的势力最强，他的威望最高，他的年龄最大，他是努尔哈赤第一个大福晋所生的唯一皇子（兄长褚英已死），他是最有可能继承父位登基为汗的，其他贝勒不会也不敢起来反对。但是，他对几个弟弟的性格、抱负、才干、势力和当时的国情，也同样是十分清楚，深悉这个新汗肩负的担子之重。他知道，阿敏素有野心，莽古尔泰桀骜不驯，皇太极胸怀大志，阿济格刚强好斗，多尔衮虽小，也不愿甘为人下，何况还有汗父宣布确定的八和硕贝勒共治国政制，自己没有力量把他们制服，使他们如同汗父在世那样听从国主的管辖。而且，半年前兵败于宁远城下，士气不振，汗父晚年的弊政又激起辽民强烈-。周围四面皆敌，明辽东巡抚袁崇焕利用宁远大捷，广修城池，训练士卒，欲图乘机收复失地。蒙古察哈尔部林丹汗也跃跃欲试，准备联明反金。朝鲜更是久欲助明反击，支持明平辽总兵官毛文龙。这种内外交困的艰难重任，代善是担当不起的。这一点，代善内心十分清楚，他的左右手岳讬、萨哈廉也非常明白。
　　代善在翌日向大贝勒阿敏、莽古尔泰及贝勒阿巴泰、德格类、济尔哈朗、阿济格、多尔衮、多铎、杜度、硕托、豪格等提议立四贝勒皇太极为汗，以八和硕贝勒共同推举的形式拥立了新汗。
　　1626年（天命十一年）农历九月一日，皇太极在大政殿即汗位，焚香告天，宣布次年为天聪元年。皇太极即位后，代善也能顾全大局，极力维护八弟皇太极的统治和权威。
　　参与军政
　　皇太极继位为汗之后，与十四位贝勒议定君臣之间的礼仪，并且盟誓昭告天地。誓词赋予代善与阿敏、莽古尔泰三位大贝勒教训子弟的特权，他们对阿巴泰、阿济格等十一位“子弟贝勒”，有管教之权、辖束之权，如果这些贝勒藐视代善三人，则将短命而亡。
　　1626年（天命十一年）农历十月初，代善和阿敏等八位贝勒，率精兵一万，往攻蒙古喀尔喀扎鲁特部，生擒巴克贝勒父子及喇什希布、戴青、桑噶尔寨等十四贝勒，斩鄂尔塞图贝勒，俘获其子女人民牲畜之后返回。
　　1627年（天聪元年）正月初一，后金国举行新年朝贺仪式，皇太极居中，代善与阿敏、莽古尔泰分坐其左右，四人并肩端坐殿上，接受群臣叩拜。
　　1629年（天聪三年）农历十一月，皇太极亲率大军征明，岳托与济尔哈朗率右翼军夜攻大安口，毁水门而入，击败马兰营援兵于城下。代善和莽古尔泰夜入御帐，不许诸贝勒大臣入内，与皇太极密议说，我军深入敌境，劳师动众人困麻烦，即使攻入明朝边境，也是敌众我寡，建议皇太极立即班师回朝。皇太极虽不满，但面对两大贝勒的共议，又不得不做出让步。当天深夜，岳托、济尔哈朗诸贝勒一起给代善、莽古尔泰施加压力，最终使代善与莽古尔泰收回成议，之后五战皆胜。后金军进逼明都北京，代善率领儿子岳托击败明朝援兵。
　　南征北战
　　1631年（天聪五年）农历八月，代善与子岳托率正红、镶红二旗兵丁，参加了皇太极发动的进攻大凌河之战，父子分领本旗兵攻城之西面。金军围城历时三月，击败总兵吴襄等来援明兵四万，生擒监军张春，迫使粮尽援断的大凌河总兵祖大寿开城投降。当时被擒各明朝-都跪拜在地上，唯独独张春不跪。皇太极大怒，拉弓想要射死张春，代善劝谏说：“这个战俘想以死成名，何必杀死他成全他？”于是，皇太极对张春置之不理。
　　1632年（天聪六年）年初，代善主动要求放弃自己与皇太极平起平坐的特权。在他的坚持下，皇太极最终同意将代善和莽古尔泰的座位低于自己，分别坐在他的左右。
　　1632年（天聪六年）农历四月，代善跟随皇太极讨伐察哈尔，越过兴安岭之后，听说林丹汗逃往远处，于是后金-移目标攻取归化城，大同、宣府，与沙河堡、得胜堡、张家口诸守将议和之后返回后金国。
　　1634年（天聪八年）农历五月，代善又跟随皇太极进攻明朝，兵出榆林口，至宣府边境外，分兵从喀喇鄂博攻占得胜堡，从朔州进取马邑，在山西大同会师之后返回。

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